Лаборатория молекулярной генетики микроорганизмов

Все бактериофаги

Thermus phage phiKo

Электронная микрофотография: Thermus phage phiKoЭлектронная микрофотография: Thermus phage phiKo
Credentials: Olga Sokolova, Denis Moiseenko
Хозяин
Thermus thermophilus HB27c
Семейство
Tectiviridae
Морфотип
other
Жизненный цикл
lytic
Тип генома
dsDNA
Длина генома, п.н.
11 129
GC-состав, %
61.7
Accession
MH673671

Карта генома

phiKo11 129 п.н. · 26 открытых рамок считывания

Инвертированный концевой повтор — 1..16 · 16 п.н.Инвертированный концевой повтор — 11 114..11 129 · 16 п.н.hypothetical protein — 85..618 (+) · 534 п.н.hypothetical protein — 615..902 (+) · 288 п.н.hypothetical protein — 908..1 102 (+) · 195 п.н.hypothetical protein — 1 113..1 496 (+) · 384 п.н.hypothetical protein — 1 557..1 775 (+) · 219 п.н.DNA polymerase B — 1 784..2 731 (+) · 948 п.н.lysozyme — 2 728..3 243 (+) · 516 п.н.head morphogenesis protein — 3 259..3 507 (+) · 249 п.н.hypothetical protein — 3 510..3 731 (+) · 222 п.н.ribonuclease Z — 3 736..3 921 (+) · 186 п.н.hypothetical protein — 3 925..4 770 (+) · 846 п.н.DNA packaging ATPase — 4 776..5 387 (+) · 612 п.н.putative major capsid protein — 5 401..6 426 (+) · 1 026 п.н.hypothetical protein — 6 440..6 814 (+) · 375 п.н.hypothetical protein — 6 823..6 996 (+) · 174 п.н.hypothetical protein — 6 983..7 123 (+) · 141 п.н.hypothetical protein — 7 125..7 277 (+) · 153 п.н.hypothetical protein — 7 288..7 602 (+) · 315 п.н.peptidase — 7 592..8 071 (+) · 480 п.н.hypothetical protein — 8 074..8 547 (+) · 474 п.н.hypothetical protein — 8 550..8 801 (+) · 252 п.н.hypothetical protein — 8 786..9 343 (+) · 558 п.н.hypothetical protein — 9 340..9 771 (+) · 432 п.н.tail protein — 9 768..10 577 (+) · 810 п.н.hypothetical protein — 10 574..10 867 (+) · 294 п.н.hypothetical protein — 10 860..11 111 (+) · 252 п.н.

Последовательности

ФайлВидВерсияРазмер
phiKo_genome.gb.gzаннотация11 KB

Описание

Связанные публикации

  1. Spacer acquisition by Type III CRISPR–Cas system during bacteriophage infection of Thermus thermophilus

    Daria Artamonova et al.

    Nucleic Acids Research2020

  2. Natural diversity of CRISPR spacers of Thermus : evidence of local spacer acquisition and global spacer exchange

    Anna Lopatina et al.

    Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences2019