Cas9 из Alkalibacillus sp. из озера Эбейты
В 2024 году я побывал на сверхсоленом озере Эбейты и собрал там пробы воды и грунта. Наша студентка Виктория Рончикова выделяла из этих образцов галофильных архей и бактерий. Среди выделенных организмов была галотолерантная бацилла Alkalibacillus sp. S2W, которая оказалась способна расти на среде с 23% соли. Мы секвенировали ее геном, и в нем обнаружился ген белка Cas9, сильно отличающегося от ранее изученных. А тем временем Богдан Кириллов занимался разработкой вычислительных методов, позволяющих идентифицировать PAM с помощью минимального количества экспериментов. В этом проекте участвовала Александра Васильева, которая выделила белок нашей бациллы и на нем валидировала богдановские методы. Эти методы сработали, и вот по этой работе вышел препринт!
